Mudanças entre as edições de "Mnemo"

Edição atual tal como às 15h57min de 16 de maio de 2016

Projeto Mnemo

4 máquinas

O projeto consiste na obtenção de 4 máquinas com memória de 64 Gb para a execução de projetos que demandem tal capacidade.

Máquina do projeto: Thermaltake V6 BlacX

Índice

1 Descrição da Máquina
- 1.1 vi /etc/hosts
- 1.2 ifconfig
2 Patrimônio e MAC
3 Instalando Fedora 20
4 Comando úteis:
5 Configuracoes

Descrição da Máquina

MICRO COMPUTADOR Thermaltake V6 BlacX [1]

Processador: Intel Core i7-4820K @ 3.70GHz (4 cores)

L1 Data Cache 32KB x 4
L1 Code Cache 32KB x 4
L2 Cache 256 kB x4
L3 Cache 10240 kB

RAM: 64GB= 8x 8192MB Kingston 1333MHz DDR3
Placa mãe: ASUSTeK, P9X79 PRO

Harddisk:
- 1000.2GB de HD WDC WD10EZEK-00RKKA0 (SATA1) (sda)
- 2 x 120 GB Ata Kingston SV300S3 (sdb, sdc)

DVD HL-DT-ST (SATA5)

Placa Gráfica

01:00.0 VGA compatible controller: NVIDIA Corporation GK106GL [Quadro K4000] (rev a1)

Mnemo:dmidecode

vi /etc/hosts

127.0.0.1   localhost localhost.localdomain localhost4 localhost4.localdomain4
::1         localhost localhost.localdomain localhost6 localhost6.localdomain6

143.54.226.118 hunter.mat.ufrgs.br hunter
143.54.226.226 one
143.54.226.128 mnemo2

ifconfig

em1:   inet   143.54.226.114  netmask 255.255.254.0   broadcast 143.54.227.255
       inet6  fe80::76d0:2bff:fe28:547  prefixlen 64  scopeid 0x20<link>
       ether 74:d0:2b:28:05:47  txqueuelen 1000  (Ethernet)

Patrimônio e MAC

Patrim    MAC              host 
537403  74:D0:2B:28:05:47  mnemo1         143.54.226.114
537404  xx:xx:xx:xx:xx:xx  mnemo2         143.54.226.128
537...  xx:xx:xx:xx:xx:xx  bulldog ???    143.54.226.xx
537...  xx:xx:xx:xx:xx:xx  hostname       143.54.226.xx

Monitores: patrimônio

XXXXXX, XXXXXX, XXXXXX, XXXXXX

Instalando Fedora 20

A partir do DVD de instalação do Fedora 20 (downloaded in 20140220).

Dar o boot via DVD
Testar a mídia (pode pular esse passo)

Escolher linguagem: English
Selecionar Ethernet: ON
Hostname: mnemo1

Selecionar time zone: São Paulo
Escolher teclado: Portuguese (Brazil)
Language Support: English, português

Software Selection:
- GNOME Desktop,
- LibreOffice
- Admistration Tools
- C Development Tools
- Design Suite
- Development Tools
- Fedora Eclipse

Criando partições

Selecione Installation Destination
Selecione os 3 drives
Clique em Full disk summary and bootloader
- Selecione o disco sdb como boot device
Selecione: I want to review/modify my disk partitions before continuing
- Partition scheme: Standard partition (parece que é necessário para SSD)
- Clique Continue

Selecione o botao com um 'mais' e adicione as partições. (É necessário mudar o 'Name'. Utilize o botão com uma chave de fenda para mudar o device. (as vezes nao atualiza na hora).

Name  Mount point  Label Capacity   FileSystem            Device Type         
sdb1  /boot/efi          250MB      EFI System Partition  Standard Partition  
sdb2  /boot              750MB      ext4                  Standard Partition  
sdb3  /                  51.2GB     ext4                  Standard Partition

sdc1  /swap              32.2 GB    swap                  Standard Partition
 
sda1  /home              900GB      ext4                  Stantard Partition

Fornecer senha root e confirmar.
Criar Usuario: dago
- Make user administrator

Criar as partições automaticamente

Selecionar Create custom layout:

/home     869.26 GB
/boot       1.0  GB
/boot/efi   200  MB
/          51.2  GB
swap       32.2  GB

Pacotes

habilitar ssh

$ systemclt enable sshd
$ systemctl start sshd

Começar com um update e restart

$ su
$ yum update

continuar com os pacotes (verificar se todos foram encontrados)

$ dnf install kile R-core
$ dnf install blas lapack gcc-gfortran scilab
$ dnf install vim emacs thunderbird
$ dnf install yumex mc lshw lshw-gui atop htop
$ dnf install freefem++
$ dnf install kernel-tools                        #(para instalar Nvidia drivers)

Placa Gráfica Nvidia

Veja dicas em [2]

Baixar drivers de http://www.nvidia.com.br/Download/index.aspx : Quadro K4000 Linux 64 bits, Performande e detalhes em [[3]]
- Driver beta atual http://us.download.nvidia.com/XFree86/Linux-x86_64/340.17/NVIDIA-Linux-x86_64-340.17.run

Desabilitando o driver nouveau

$ vi /etc/modprobe.d/blacklist.conf
$ blacklist nouveau

Crie um novo “initramfs” (crie backup)

$ mv /boot/initramfs-$(uname -r).img /boot/initramfs-$(uname -r).img.bak  
$ dracut -v /boot/initramfs-$(uname -r).img $(uname -r)
$ reboot

Logar como root (iniciar como modo 3)

$ sudo init 3

ou

Inicia a máquina com modo 3.
- No grub , adicione no fim da linha abaixo o número 3 e reboot (F10):

 linuxefi /vmlinuz-...     ... 3

Execute

$ cd /home/user/Downloads
$ chmod +x NVIDIA-Linux-x86_64-340.17.run
$ ./NVIDIA-Linux-x86_64-340.17.run

Sign the kernel
Generate a new pair
Install signed kernel
Install 32 bit Nvidia (Yes)
Yes

$ reboot

outros

Reboot e desabilite o 'secure mode' na BIOS (F2)

Va em Modo avançado > boot > CSM (Compatibility Support Module)
- Launch CSM (Disabled)

Instalando CUDA

[CUDA]

Lista de pacotes extras

Linux:Pacotes

Selecione o conjunto de pacotes Software Development:
Selecione Customize now para escolher pacotes extras

Selecione os pacotes abaixo

Desktop Environments/XFCE
Desktop Environments/GNOME (ELIMINAR)
Applications/Editors/Emacs
Applications/Editors/vim
Applications/Graphical Internet/Firefox
Applications/Graphical Internet/java-1.6.0
Applications/Graphical Internet/Thunderbird
Applications/Graphics (0)
Development/Deveopment Tools/cmake
Development/GNOME Software Development (0)
Servers/Server Configurations tools
Base System/Administration Tools
base System/System Tools

Outros (Head Node)

Servers/MySQL
Servers/DNS Name
Servers/Windows File System
Applications/Java Development

Comando úteis:

atualiza nomes e dados de placas (não fez diferença)

[user] update-pciids

Configuracoes

Dropbox

Instale o dropbox, baixe o arquivo dropbox.py de https://www.dropbox.com/install e inicie automaticamente

cd ~ && wget -O - "https://www.dropbox.com/download?plat=lnx.x86" | tar xzf -
cd .dropbox
wget https://www.dropbox.com/download?dl=packages/dropbox.py
chmod +x dropbox.py
./dropbox.py autostart y

cd ~ && wget -O - "https://www.dropbox.com/download?plat=lnx.x86_64" | tar xzf -
mv

- Para iniciar automaticamente

to have it autostart, download the dropbox.py file per the link in the text. chmod +x it, then dropbox.py autostart y

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Edição atual tal como às 15h57min de 16 de maio de 2016

Índice

Descrição da Máquina

vi /etc/hosts

ifconfig

Patrimônio e MAC

Instalando Fedora 20

Criando partições

Criar as partições automaticamente

Pacotes

Placa Gráfica Nvidia

outros

Instalando CUDA

Lista de pacotes extras

Comando úteis:

Configuracoes

Menu de navegação

Ferramentas pessoais

Domínios

Variantes

Visualizações

Mais

Pesquisa

Navegação

Ferramentas

@@ Linha 8: / Linha 8: @@
 * Máquina do projeto: [[Thermaltake V6 BlacX]]
-==Máquina==
+==Descrição da Máquina==
-Descrição de uma máquina:
 MICRO COMPUTADOR Thermaltake V6 BlacX [https://www.compujob.com.br/produto-upgrade/pgabinetethermaltakev6dockingstation.ptml]
-*HP COMPAQ DC5800 Microtorre: [http://bizsupport1.austin.hp.com/bc/docs/support/SupportManual/c01363847/c01363847.pdf Manual DC5800]
+; Processador: Intel Core [http://ark.intel.com/products/77781/Intel-Core-i7-4820K-Processor-10M-Cache-up-to-3_90-GHz?q=i7-4820 i7-4820K] @ 3.70GHz (4 cores)
-*Processador Intel Core i7-4820K @ 3.70GHz (4 cores)
+* L1 Data Cache 32KB x 4
-*64GB de memória RAM, 8 pentes de Kingston 8192MB 1333MHz DDR3
+* L1 Code Cache 32KB x 4
-*1000.2GB de HD WDC WD10EZEK-00RKKA0 (SATA1)
+* L2 Cache 256 kB x4
-*DVD HL-DT-ST (SATA5)
+* L3 Cache 10240 kB
-** L1 Data Cache 32KB x 4
-** L1 Code Cache 32KB x 4
-** L2 Cache 256 kB x4
-** L3 Cache 10240 kB
-* Rede:
+; RAM      : 64GB= 8x 8192MB Kingston  1333MHz DDR3
-* USB: Portas
+; Placa mãe: ASUSTeK, P9X79 PRO
-<!-- * Valor estimado : R$ 1.350,00 x 16 = R$ 21.600,00 -->
+* Harddisk:
-* [[Minicluster:Hardware:dmidecode]]
+** 1000.2GB de HD WDC WD10EZEK-00RKKA0 (SATA1) (sda)
+** 2 x 120 GB Ata Kingston SV300S3             (sdb, sdc)
+; DVD HL-DT-ST (SATA5)
-===Processadores===
+; Placa Gráfica:
-* [http://ark.intel.com/Product.aspx?id=36503 Intel Core 2 Duo 7500] ou [http://processorfinder.intel.com/Details.aspx?sSpec=SLB9Z], 3M Cache, 2.93 GHz, 1066 MHz FSB
+:00.0 VGA compatible controller: NVIDIA Corporation GK106GL [Quadro K4000] (rev a1)
+* [[Mnemo:dmidecode]]
 === vi /etc/hosts ===
-.0.0.1       one.matrix      one     localhost.localdomain   localhost
+.0.0.1   localhost localhost.localdomain localhost4 localhost4.localdomain4
-  ::1     one.matrix      one     localhost6.localdomain6 localhost6
+  ::1         localhost localhost.localdomain localhost6 localhost6.localdomain6
- ## retirada linha acima pois dois nodes achavam que eram one.matrix
- ## ::1  one.matrix      one     localhost6.localdomain6 localhost6
-.54.226.61   euler.mat.ufrgs.br  euler
+.54.226.118 hunter.mat.ufrgs.br hunter
-.54.226.118  hunter.mat.ufrgs.br hunter
+.54.226.226 one
+.54.226.128 mnemo2
-.168.0.50  switch
-.168.0.100 automato-eth0
-.168.0.108 cell108
-.168.0.109 cell109
-.168.0.110 cell110
-.168.0.111 cell111
-.168.0.112 cell112
-.168.0.113 cell113
-.168.0.114 cell114
-.168.0.115 cell115
-.168.0.116 cell116
-.168.0.117 cell117
-.168.0.118 cell118
-.168.0.119 cell119
-.168.0.120 cell120
-.168.0.121 cell121
-.168.0.122 cell122
-.168.0.123 cell123
 ===ifconfig===
-* '''one'''
+  em1:   inet   143.54.226.114  netmask 255.255.254.0   broadcast 143.54.227.255
-      HWaddr            Hostname      inet addr:     Bcast:         Mask:         Link encap: inet6 addr:                 Scope:
+        inet6  fe80::76d0:2bff:fe28:547  prefixlen 64  scopeid 0x20<link>
-  eth0 00:06:4F:61:C4:5A cellauto-eth0 192.168.0.100  192.168.0.255  255.255.255.0 Ethernet    fe80::206:4fff:fe61:c45a/64 Link
+        ether 74:d0:2b:28:05:47  txqueuelen 1000  (Ethernet)
- eth1 18:A9:05:E8:1E:16 one.matrix    143.54.226.166 143.54.227.255 255.255.254.0 Ethernet    fe80::1aa9:5ff:fee8:1e16/64 Link
-  eth2 00:0A:5E:5C:2C:04               192.168.0.100  192.168.0.255  255.255.255.0 Ethernet
- lo                                   127.0.0.1                     255.0.0.0     Local Loopback ::1/128                  Host
-* '''cell101'''
- eth0 18:A9:05:E8:0E:B8 cell101       192.168.0.101  192.168.0.255  255.255.255.0 Ethernet    fe80::1aa9:5ff:fee8:eb8/64  Link
- lo                                   127.0.0.1                     255.0.0.0     Local Loopback ::1/128                  Host
-Trocar ip do mestre
-  vi /etc/sysconfig/network-scripts/
-* http://www.cyberciti.biz/faq/rhel-centos-fedoracore-linux-network-card-configuration/
 == Patrimônio e MAC ==
   Patrim    MAC              host
- XXXXXX   ---               monitor
+  74:D0:2B:28:05:47  mnemo1         143.54.226.114
- XXXXXX   ---               monitor
+xx:xx:xx:xx:xx:xx  mnemo2         143.54.226.128
- XXXXXX   ---               monitor
+...  xx:xx:xx:xx:xx:xx  bulldog ???    143.54.226.xx
- XXXXXX   ---               monitor
+...  xx:xx:xx:xx:xx:xx  hostname       143.54.226.xx
-  74:D0:2B:28:05:47  hostname       xxx.xxx.xx.xx
-74:D0:2B:28:05:47  hostname       xxx.xxx.xx.xx
-74:D0:2B:28:05:47  hostname       xxx.xxx.xx.xx
-74:D0:2B:28:05:47  hostname       xxx.xxx.xx.xx
-==Comando úteis: ==
-* atualiza nomes e dados de placas (não fez diferença)
- [user] update-pciids
-* https://www.linuxquestions.org/questions/linux-networking-3/how-do-i-assign-switch-eth0-and-eth1-308008/
+Monitores: patrimônio
-* http://writeonly.wordpress.com/2009/05/08/installing-a-reluctant-network-card-on-debian/
+ XXXXXX, XXXXXX, XXXXXX, XXXXXX
+==Instalando Fedora 20==
-==Fedora 20==
 A partir do DVD de instalação do Fedora 20 (downloaded in 20140220).
@@ Linha 115: / Linha 63: @@
 * Selecionar time zone: São Paulo
-* Escolher teclado:     Portuguese (Brazil, nativo)
+* Escolher teclado:     Portuguese (Brazil)
 * Language Support:     English, português
-* Software Selection:  GNOME Desktop,
+* Software Selection:
-                       LibreOffice, Admistration Tools, C Development Tools, Design Suite, Development Tools, Fedora Eclipse
+** GNOME Desktop,
+** LibreOffice
+** Admistration Tools
+** C Development Tools
+** Design Suite
+** Development Tools
+** Fedora Eclipse
-* Escolher: Basic Storage Devices
-* Selecionar o drive: (ATA ST32500318AS) com tamanho 238475 MB (Serial Number 9VY0K045)
+===Criando partições===
+* Selecione Installation Destination
+* Selecione os 3 drives
+* Clique em Full disk summary and bootloader
+** Selecione o disco sdb como boot device
+* Selecione: I want to review/modify my disk partitions before continuing
+** Partition scheme: Standard partition (parece que é necessário para SSD)
+** Clique Continue
+Selecione o botao com um 'mais' e adicione as partições. (É necessário mudar o 'Name'. Utilize o botão com uma chave de fenda para mudar o device. (as vezes nao atualiza na hora).
+ Name  Mount point  Label Capacity   FileSystem            Device Type
+ sdb1  /boot/efi          250MB      EFI System Partition  Standard Partition
+ sdb2  /boot              750MB      ext4                  Standard Partition
+ sdb3  /                  51.2GB     ext4                  Standard Partition
+ sdc1  /swap              32.2 GB    swap                  Standard Partition
+ sda1  /home              900GB      ext4                  Stantard Partition
 * Fornecer senha root e confirmar.
+* Criar Usuario: dago
+** Make user administrator
+====Criar as partições automaticamente====
-===Partições===
-Criar as partições sem apagar as antigas ('''NÃO''' apagar a partição de Recovery que possui tamanho 16386 MB).
 * Selecionar Create custom layout:
-* A partição Windows será encolhida para 50000 MB.
+ /home     869.26 GB
-** Selecione /dev/sda1.
+ /boot       1.0  GB
-** Selecione ''Resize'' e o tamanho 50000 MB.
+ /boot/efi   200  MB
+ /          51.2  GB
+ swap       32.2  GB
-* Criar partição '''/boot'''
+===Pacotes===
-** Clique em '''Create''' e '''Standard Partition'''.
+* habilitar ssh
-** Em '''Mount Point''' selecione '''/boot'''
+ $ systemclt enable sshd
-** Em '''File System Type''' selecione '''ext3''' ('''tem''' de ser do tipo '''ext3''')
+ $ systemctl start sshd
-** Em '''Size''' informe 1000 (MB)
-* Criar partição '''swap'''
-** Clique em '''Create''' e '''Standard Partition'''.
+* Começar com um update e restart
-** Em '''File System Type''' selecione '''swap'''
+ $ su
-** Em '''Size''' informe 5000 (MB)
+ $ yum update
-* Criar partição '''/'''
+continuar com os pacotes (verificar se todos foram encontrados)
-** Clique em '''Create''' e '''Standard Partition'''.
+ $ dnf install kile R-core
-** Em '''Mount Point''' selecione '''/'''
+ $ dnf install blas lapack gcc-gfortran scilab
-** Em '''File System Type''' selecione '''ext4'''
+ $ dnf install vim emacs thunderbird
-** Em '''Size''' informe 40000 (MB)
+ $ dnf install yumex mc lshw lshw-gui atop htop
+ $ dnf install freefem++
+ $ dnf install kernel-tools                        #(para instalar Nvidia drivers)
-* Clique em '''Next''' e '''Write changes to disk'''
+===Placa Gráfica Nvidia===
- Em caso de falha, rodar no windows duas vezes
- chkdsk /f
-***https://bugzilla.redhat.com/show_bug.cgi?id=502422
-* Confirme que '''Fedora''' é o sistema a ser carregado por Default.
-===Pacotes===
+Veja dicas em [http://www.tecmint.com/install-nvidia-drivers-in-linux/]
+* Baixar drivers de http://www.nvidia.com.br/Download/index.aspx : Quadro K4000 Linux 64 bits, Performande e detalhes em [[http://www.techpowerup.com/gpudb/1841/quadro-k4000.html]]
+** Driver beta atual http://us.download.nvidia.com/XFree86/Linux-x86_64/340.17/NVIDIA-Linux-x86_64-340.17.run
+;Desabilitando o driver nouveau:
+ $ vi /etc/modprobe.d/blacklist.conf
+ $ blacklist nouveau
+; Crie um novo “initramfs” (crie backup)
+ $ mv /boot/initramfs-$(uname -r).img /boot/initramfs-$(uname -r).img.bak
+ $ dracut -v /boot/initramfs-$(uname -r).img $(uname -r)
+ $ reboot
+* Logar como root (iniciar como modo 3)
+ $ sudo init 3
+ou
+* Inicia a máquina com modo 3.
+** No grub , adicione no fim da linha abaixo o número 3 e reboot (F10):
+  linuxefi /vmlinuz-...     ... 3
+Execute
+ $ cd /home/user/Downloads
+ $ chmod +x NVIDIA-Linux-x86_64-340.17.run
+ $ ./NVIDIA-Linux-x86_64-340.17.run
+* Sign the kernel
+* Generate a new pair
+* Install signed kernel
+* Install 32 bit Nvidia (Yes)
+* Yes
+ $ reboot
+=== outros ===
+Reboot e desabilite o 'secure mode' na BIOS  (F2)
+* Va em Modo avançado > boot > CSM (Compatibility Support Module)
+** Launch CSM  (Disabled)
+=== Instalando CUDA ===
+[CUDA]
+===Lista de pacotes extras===
 * [[Linux:Pacotes]]
@@ Linha 176: / Linha 191: @@
 * Base System/Administration Tools
 * base System/System Tools
 Outros (Head Node)
@@ Linha 183: / Linha 197: @@
 * Servers/Windows File System
 * Applications/Java Development
+==Comando úteis: ==
+* atualiza nomes e dados de placas (não fez diferença)
+ [user] update-pciids
+* https://www.linuxquestions.org/questions/linux-networking-3/how-do-i-assign-switch-eth0-and-eth1-308008/
+* http://writeonly.wordpress.com/2009/05/08/installing-a-reluctant-network-card-on-debian/
+== Configuracoes ==
+* Dropbox
+Instale o dropbox, baixe o arquivo dropbox.py de https://www.dropbox.com/install e inicie automaticamente
+ cd ~ && wget -O - "https://www.dropbox.com/download?plat=lnx.x86" | tar xzf -
+ cd .dropbox
+ wget https://www.dropbox.com/download?dl=packages/dropbox.py
+ chmod +x dropbox.py
+ ./dropbox.py autostart y
-===Welcome===
-Passos finais de configuração (depois de dar o boot)
-* Forward
+ cd ~ && wget -O - "https://www.dropbox.com/download?plat=lnx.x86_64" | tar xzf -
-* Forward
+ mv
-* Crie um usuário comum: dago
+** Para iniciar automaticamente
+to have it autostart, download the dropbox.py file per the link in the text. chmod +x it, then
+dropbox.py autostart y