Mudanças entre as edições de "Minicluster:Linux"
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O pacote [http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpich2/downloads/index.php?s=downloads MPICH2] é fornecido para os Linux: | O pacote [http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpich2/downloads/index.php?s=downloads MPICH2] é fornecido para os Linux: | ||
* Debian 1.2.1 | * Debian 1.2.1 | ||
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* [http://www.pcworld.idg.com.au/article/208829/debian_linux_cluster_beats_supercomputer_tsunami_warnings?pp=1] ''We tried several Linux flavours, including Red Hat, Mandrake, Fedora etc,...'''Debian''' as the most stable in servers, especially when things are being done pretty much in automatic mode. In our workstations the preference among programmers is Ubuntu, which is basically Debian-based...'' | * [http://www.pcworld.idg.com.au/article/208829/debian_linux_cluster_beats_supercomputer_tsunami_warnings?pp=1] ''We tried several Linux flavours, including Red Hat, Mandrake, Fedora etc,...'''Debian''' as the most stable in servers, especially when things are being done pretty much in automatic mode. In our workstations the preference among programmers is Ubuntu, which is basically Debian-based...'' | ||
− | Mesmo assim, não há preferências claras e acabamos escolhendo o Fedora pois possui ampla documentação na internet e está em contínua atualização. No momento a versão atual é [http://www.fedoraproject.org Fedora | + | Mesmo assim, não há preferências claras e acabamos escolhendo o Fedora pois possui ampla documentação na internet e está em contínua atualização. No momento a versão atual é [http://www.fedoraproject.org Fedora 13] e a máquina possui '''arquitetura x86-64'''. |
==Windows XP== | ==Windows XP== | ||
− | Optei não apagar a instalação do Windows XP. | + | Optei não apagar a instalação do Windows XP. |
* Ligar a máquina e terminar a instalação do Windows XP | * Ligar a máquina e terminar a instalação do Windows XP | ||
* Baixar atualizações disponíveis | * Baixar atualizações disponíveis | ||
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==Fedora== | ==Fedora== | ||
− | A partir do DVD de instalação do Fedora | + | A partir do DVD de instalação do Fedora 13 (downloaded in 20100607). Em caso de erros pode ser útil acessar os [[Linux:Virtual Consoles]]. |
* Dar o boot via DVD | * Dar o boot via DVD | ||
* Testar a mídia (pode pular esse passo) | * Testar a mídia (pode pular esse passo) | ||
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+ | * Na tela gráfica inicial: clique ''Next'' | ||
* Escolher linguagem: English | * Escolher linguagem: English | ||
* Escolher teclado: Brazilian (ABNT2) | * Escolher teclado: Brazilian (ABNT2) | ||
− | * | + | * Escolher: Basic Storage Devices |
+ | * Selecionar o drive: (ATA ST3250318AS) com tamanho 238475 MB (Serial Number 9VY0K045) | ||
* Hostname: cell100.matrix (seguir com cell101,cell102,cell103,...,cell115) | * Hostname: cell100.matrix (seguir com cell101,cell102,cell103,...,cell115) | ||
* Selecionar time zone: São Paulo | * Selecionar time zone: São Paulo | ||
+ | * Fornecer senha root e confirmar. | ||
===Partições=== | ===Partições=== | ||
− | + | Criar as partições sem apagar as antigas ('''NÃO''' apagar a partição de Recovery que possui tamanho 16386 MB). | |
* Selecionar Create custom layout: | * Selecionar Create custom layout: | ||
* A partição Windows será encolhida para 50000 MB. | * A partição Windows será encolhida para 50000 MB. | ||
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* Criar partição '''/boot''' | * Criar partição '''/boot''' | ||
− | ** Clique em ''' | + | ** Clique em '''Create''' e '''Standard Partition'''. |
** Em '''Mount Point''' selecione '''/boot''' | ** Em '''Mount Point''' selecione '''/boot''' | ||
** Em '''File System Type''' selecione '''ext3''' ('''tem''' de ser do tipo '''ext3''') | ** Em '''File System Type''' selecione '''ext3''' ('''tem''' de ser do tipo '''ext3''') | ||
** Em '''Size''' informe 1000 (MB) | ** Em '''Size''' informe 1000 (MB) | ||
* Criar partição '''swap''' | * Criar partição '''swap''' | ||
− | ** Clique em ''' | + | ** Clique em '''Create''' e '''Standard Partition'''. |
** Em '''File System Type''' selecione '''swap''' | ** Em '''File System Type''' selecione '''swap''' | ||
** Em '''Size''' informe 5000 (MB) | ** Em '''Size''' informe 5000 (MB) | ||
* Criar partição '''/''' | * Criar partição '''/''' | ||
− | ** Clique em ''' | + | ** Clique em '''Create''' e '''Standard Partition'''. |
** Em '''Mount Point''' selecione '''/''' | ** Em '''Mount Point''' selecione '''/''' | ||
** Em '''File System Type''' selecione '''ext4''' | ** Em '''File System Type''' selecione '''ext4''' | ||
** Em '''Size''' informe 40000 (MB) | ** Em '''Size''' informe 40000 (MB) | ||
+ | * Clique em '''Next''' e '''Write changes to disk''' | ||
Em caso de falha, rodar no windows duas vezes | Em caso de falha, rodar no windows duas vezes | ||
chkdsk /f | chkdsk /f | ||
***https://bugzilla.redhat.com/show_bug.cgi?id=502422 | ***https://bugzilla.redhat.com/show_bug.cgi?id=502422 | ||
+ | |||
+ | * Confirme que '''Fedora''' é o sistema a ser carregado por Default. | ||
===Pacotes=== | ===Pacotes=== | ||
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* Applications/Graphical Internet/Firefox | * Applications/Graphical Internet/Firefox | ||
* Applications/Graphical Internet/java-1.6.0 | * Applications/Graphical Internet/java-1.6.0 | ||
− | * Applications/Graphical Internet/ | + | * Applications/Graphical Internet/Thunderbird |
* Applications/Graphics (0) | * Applications/Graphics (0) | ||
* Development/Deveopment Tools/cmake | * Development/Deveopment Tools/cmake | ||
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* Servers/DNS Name | * Servers/DNS Name | ||
* Servers/Windows File System | * Servers/Windows File System | ||
+ | * Applications/Java Development | ||
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==Welcome== | ==Welcome== | ||
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yum update | yum update | ||
yum install mpich\* | yum install mpich\* | ||
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=Two cores ALIVE= | =Two cores ALIVE= | ||
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Mem: 2031852k total, 1858956k used, 172896k free, 109204k buffers | Mem: 2031852k total, 1858956k used, 172896k free, 109204k buffers | ||
Swap: 5119988k total, 0k used, 5119988k free, 1028704k cached | Swap: 5119988k total, 0k used, 5119988k free, 1028704k cached | ||
− | + | ||
PID USER PR NI VIRT SHR S %CPU %MEM TIME+ PPID <font color='red'>P</font> TIME CODE COMMAND | PID USER PR NI VIRT SHR S %CPU %MEM TIME+ PPID <font color='red'>P</font> TIME CODE COMMAND | ||
13192 root 20 0 398m 8148 S 3.2 4.8 0:06.85 13168 <font color='red'>0</font> 0:06 4 <font color='red'>programa1</font> | 13192 root 20 0 398m 8148 S 3.2 4.8 0:06.85 13168 <font color='red'>0</font> 0:06 4 <font color='red'>programa1</font> | ||
− | 12793 dago 20 0 544m 18m S 0.3 1.5 0:04.14 1 <font color='red'>1</font> 0:04 4 <font color='red'>top</font> | + | 12793 dago 20 0 544m 18m S 0.3 1.5 0:04.14 1 <font color='red'>1</font> 0:04 4 <font color='red'>top</font> |
− | + | ||
Veja o manual com | Veja o manual com | ||
man top | man top | ||
Linha 131: | Linha 142: | ||
: f : adiciona mais colunas. Use ''j'' para coluna processador | : f : adiciona mais colunas. Use ''j'' para coluna processador | ||
: z : habilita cores | : z : habilita cores | ||
− | : u : mostra um usuário | + | : u : mostra um usuário especi~fico |
: W : Escreve arquivo de configuração | : W : Escreve arquivo de configuração | ||
Salve suas configurações com a opção ''W''. | Salve suas configurações com a opção ''W''. | ||
Linha 139: | Linha 150: | ||
* O kernel '''2.6.31.5-127.fc12.x86_64''' está FUNCIONANDO. | * O kernel '''2.6.31.5-127.fc12.x86_64''' está FUNCIONANDO. | ||
+ | |||
==Veja também== | ==Veja também== | ||
Linha 147: | Linha 159: | ||
* http://www.phy.duke.edu/~rgb/brahma//beowulf_book/beowulf_book.html | * http://www.phy.duke.edu/~rgb/brahma//beowulf_book/beowulf_book.html | ||
* http://www.westgrid.ca/support/software | * http://www.westgrid.ca/support/software | ||
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Edição das 22h20min de 10 de junho de 2010
Índice
Fedora 13
O pacote MPICH2 é fornecido para os Linux:
- Debian 1.2.1
- Ubuntu 1.2 (based on Debian)
- Fedora/RHEL/CentOS 1.2.1
- Gentoo
- FreeBSD 1.2.1
Uma opinião do controle de Tsunamis
- [1] We tried several Linux flavours, including Red Hat, Mandrake, Fedora etc,...Debian as the most stable in servers, especially when things are being done pretty much in automatic mode. In our workstations the preference among programmers is Ubuntu, which is basically Debian-based...
Mesmo assim, não há preferências claras e acabamos escolhendo o Fedora pois possui ampla documentação na internet e está em contínua atualização. No momento a versão atual é Fedora 13 e a máquina possui arquitetura x86-64.
Windows XP
Optei não apagar a instalação do Windows XP.
- Ligar a máquina e terminar a instalação do Windows XP
- Baixar atualizações disponíveis
- Desfragmentar o drive C:
- IMPORTANTE: Rodar no windows duas vezes (caso haja falhas no disco a instalação abaixo é cancelada!!)
chkdsk /f
Fedora
A partir do DVD de instalação do Fedora 13 (downloaded in 20100607). Em caso de erros pode ser útil acessar os Linux:Virtual Consoles.
- Dar o boot via DVD
- Testar a mídia (pode pular esse passo)
- Na tela gráfica inicial: clique Next
- Escolher linguagem: English
- Escolher teclado: Brazilian (ABNT2)
- Escolher: Basic Storage Devices
- Selecionar o drive: (ATA ST3250318AS) com tamanho 238475 MB (Serial Number 9VY0K045)
- Hostname: cell100.matrix (seguir com cell101,cell102,cell103,...,cell115)
- Selecionar time zone: São Paulo
- Fornecer senha root e confirmar.
Partições
Criar as partições sem apagar as antigas (NÃO apagar a partição de Recovery que possui tamanho 16386 MB).
- Selecionar Create custom layout:
- A partição Windows será encolhida para 50000 MB.
- Selecione /dev/sda1.
- Selecione Resize e o tamanho 50000 MB.
- Criar partição /boot
- Clique em Create e Standard Partition.
- Em Mount Point selecione /boot
- Em File System Type selecione ext3 (tem de ser do tipo ext3)
- Em Size informe 1000 (MB)
- Criar partição swap
- Clique em Create e Standard Partition.
- Em File System Type selecione swap
- Em Size informe 5000 (MB)
- Criar partição /
- Clique em Create e Standard Partition.
- Em Mount Point selecione /
- Em File System Type selecione ext4
- Em Size informe 40000 (MB)
- Clique em Next e Write changes to disk
Em caso de falha, rodar no windows duas vezes chkdsk /f
- Confirme que Fedora é o sistema a ser carregado por Default.
Pacotes
- Selecione o conjunto de pacotes Software Development:
- Selecione Customize now para escolher pacotes extras
Selecione os pacotes abaixo
- Desktop Environments/XFCE
- Desktop Environments/GNOME (ELIMINAR)
- Applications/Editors/Emacs
- Applications/Editors/vim
- Applications/Graphical Internet/Firefox
- Applications/Graphical Internet/java-1.6.0
- Applications/Graphical Internet/Thunderbird
- Applications/Graphics (0)
- Development/Deveopment Tools/cmake
- Development/GNOME Software Development (0)
- Servers/Server Configurations tools
- Base System/Administration Tools
- base System/System Tools
Outros (Head Node)
- Servers/MySQL
- Servers/DNS Name
- Servers/Windows File System
- Applications/Java Development
Welcome
Passos finais de configuração (depois de dar o boot)
- Forward
- Forward
- Crie um usuário comum: dago
Depois de instalar
Para entrar na internet
- Foi informado o nome da máquina phum (seguindo phdois,phtres,...)
- Recebeu o IP 143.54.226.166
Update
Atualizar os pacotes do Linux
yum update yum install mpich\*
Two cores ALIVE
grep -i core /proc/cpuinfo
model name : Intel(R) Core(TM)2 Duo CPU E7500 @ 2.93GHz core id : 0 cpu cores : 2 model name : Intel(R) Core(TM)2 Duo CPU E7500 @ 2.93GHz core id : 1 cpu cores : 2
Comando top
O comando top é utilizado para verificar quais processos estão rodando.
[user] $ top Tasks: 168 total, 2 running, 166 sleeping, 0 stopped, 0 zombie Cpu0 : 1.0%us, 0.8%sy, 0.0%ni, 77.1%id, 20.6%wa, 0.4%hi, 0.0%si, 0.0%st Cpu1 : 1.3%us, 0.9%sy, 0.0%ni, 80.8%id, 17.0%wa, 0.0%hi, 0.0%si, 0.0%st Mem: 2031852k total, 1858956k used, 172896k free, 109204k buffers Swap: 5119988k total, 0k used, 5119988k free, 1028704k cached
PID USER PR NI VIRT SHR S %CPU %MEM TIME+ PPID P TIME CODE COMMAND 13192 root 20 0 398m 8148 S 3.2 4.8 0:06.85 13168 0 0:06 4 programa1 12793 dago 20 0 544m 18m S 0.3 1.5 0:04.14 1 1 0:04 4 top
Veja o manual com
man top
- Opções interessantes
- clique no programa top aberto.
- h : mostra um help
- 1 : mostra um/ou mais processadores
- f : adiciona mais colunas. Use j para coluna processador
- z : habilita cores
- u : mostra um usuário especi~fico
- W : Escreve arquivo de configuração
Salve suas configurações com a opção W.
Problemas
- O kernel 2.6.32.11-99.fc12.x86_64 NÃO está terminando de dar o boot (tranca depois de habilitar a tela gráfica sem fornecer a caixa para login).
- O kernel 2.6.31.5-127.fc12.x86_64 está FUNCIONANDO.
Veja também
- Voltar a Minicluster
- Minicluster:Hardware