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Edição das 11h21min de 5 de agosto de 2015

Projeto Mnemo


  • 4 máquinas

O projeto consiste na obtenção de 4 máquinas com memória de 64 Gb para a execução de projetos que demandem tal capacidade.

Descrição da Máquina

MICRO COMPUTADOR Thermaltake V6 BlacX [1]

Processador
Intel Core i7-4820K @ 3.70GHz (4 cores)
  • L1 Data Cache 32KB x 4
  • L1 Code Cache 32KB x 4
  • L2 Cache 256 kB x4
  • L3 Cache 10240 kB
RAM  
64GB= 8x 8192MB Kingston 1333MHz DDR3
Placa mãe
ASUSTeK, P9X79 PRO
  • Harddisk:
    • 1000.2GB de HD WDC WD10EZEK-00RKKA0 (SATA1) (sda)
    • 2 x 120 GB Ata Kingston SV300S3 (sdb, sdc)
DVD HL-DT-ST (SATA5)
Placa Gráfica
01:00.0 VGA compatible controller: NVIDIA Corporation GK106GL [Quadro K4000] (rev a1)

vi /etc/hosts

127.0.0.1   localhost localhost.localdomain localhost4 localhost4.localdomain4
::1         localhost localhost.localdomain localhost6 localhost6.localdomain6

143.54.226.118 hunter.mat.ufrgs.br hunter
143.54.226.226 one
143.54.226.128 mnemo2

ifconfig

em1:   inet   143.54.226.114  netmask 255.255.254.0   broadcast 143.54.227.255
       inet6  fe80::76d0:2bff:fe28:547  prefixlen 64  scopeid 0x20<link>
       ether 74:d0:2b:28:05:47  txqueuelen 1000  (Ethernet)

Patrimônio e MAC

Patrim    MAC              host 
537403  74:D0:2B:28:05:47  mnemo1         143.54.226.114
537404  xx:xx:xx:xx:xx:xx  mnemo2         143.54.226.128
537...  xx:xx:xx:xx:xx:xx  bulldog ???    143.54.226.xx
537...  xx:xx:xx:xx:xx:xx  hostname       143.54.226.xx

Monitores: patrimônio

XXXXXX, XXXXXX, XXXXXX, XXXXXX

Instalando Fedora 20

A partir do DVD de instalação do Fedora 20 (downloaded in 20140220).

  • Dar o boot via DVD
  • Testar a mídia (pode pular esse passo)
  • Escolher linguagem: English
  • Selecionar Ethernet: ON
  • Hostname: mnemo1
  • Selecionar time zone: São Paulo
  • Escolher teclado: Portuguese (Brazil)
  • Language Support: English, português
  • Software Selection:
    • GNOME Desktop,
    • LibreOffice
    • Admistration Tools
    • C Development Tools
    • Design Suite
    • Development Tools
    • Fedora Eclipse



Criando partições

  • Selecione Installation Destination
  • Selecione os 3 drives
  • Clique em Full disk summary and bootloader
    • Selecione o disco sdb como boot device
  • Selecione: I want to review/modify my disk partitions before continuing
    • Partition scheme: Standard partition (parece que é necessário para SSD)
    • Clique Continue

Selecione o botao com um 'mais' e adicione as partições. (É necessário mudar o 'Name'. Utilize o botão com uma chave de fenda para mudar o device. (as vezes nao atualiza na hora).

Name  Mount point  Label Capacity   FileSystem            Device Type         
sdb1  /boot/efi          250MB      EFI System Partition  Standard Partition  
sdb2  /boot              750MB      ext4                  Standard Partition  
sdb3  /                  51.2GB     ext4                  Standard Partition

sdc1  /swap              32.2 GB    swap                  Standard Partition
 
sda1  /home              900GB      ext4                  Stantard Partition
  • Fornecer senha root e confirmar.
  • Criar Usuario: dago
    • Make user administrator

Criar as partições automaticamente

  • Selecionar Create custom layout:
/home     869.26 GB
/boot       1.0  GB
/boot/efi   200  MB
/          51.2  GB
swap       32.2  GB

Pacotes

  • Começar com um update e restart
$ su
$ yum update 

continuar com os pacotes (verificar se todos foram encontrados)

$ yum install blas lapack gcc-gfortran
$ yum install vim emacs thunderbird
$ yum install yumex mc lshw lshw-gui atop htop
$ yum install freefem++
$ yum install kernel-tools                        #(para instalar Nvidia drivers)

Placa Gráfica Nvidia

Veja dicas em [2]

Desabilitando o driver nouveau
$ vi /etc/modprobe.d/blacklist.conf
$ blacklist nouveau
Crie um novo “initramfs” (crie backup)
$ mv /boot/initramfs-$(uname -r).img /boot/initramfs-$(uname -r).img.bak  
$ dracut -v /boot/initramfs-$(uname -r).img $(uname -r)
$ reboot
  • Logar como root (iniciar como modo 3)
$ sudo init 3

ou

  • Inicia a máquina com modo 3.
    • No grub , adicione no fim da linha abaixo o número 3 e reboot (F10):
 linuxefi /vmlinuz-...     ... 3 

Execute

$ cd /home/user/Downloads
$ chmod +x NVIDIA-Linux-x86_64-340.17.run
$ ./NVIDIA-Linux-x86_64-340.17.run
  • Sign the kernel
  • Generate a new pair
  • Install signed kernel
  • Install 32 bit Nvidia (Yes)
  • Yes
$ reboot

Reboot e desabilite o 'secure mode' na BIOS (F2)

  • Va em Modo avançado > boot > CSM (Compatibility Support Module)
    • Launch CSM (Disabled)

Instalando CUDA

[CUDA]

Lista de pacotes extras

  • Selecione o conjunto de pacotes Software Development:
  • Selecione Customize now para escolher pacotes extras

Selecione os pacotes abaixo

  • Desktop Environments/XFCE
  • Desktop Environments/GNOME (ELIMINAR)
  • Applications/Editors/Emacs
  • Applications/Editors/vim
  • Applications/Graphical Internet/Firefox
  • Applications/Graphical Internet/java-1.6.0
  • Applications/Graphical Internet/Thunderbird
  • Applications/Graphics (0)
  • Development/Deveopment Tools/cmake
  • Development/GNOME Software Development (0)
  • Servers/Server Configurations tools
  • Base System/Administration Tools
  • base System/System Tools

Outros (Head Node)

  • Servers/MySQL
  • Servers/DNS Name
  • Servers/Windows File System
  • Applications/Java Development

Comando úteis:

  • atualiza nomes e dados de placas (não fez diferença)
[user] update-pciids


Configuracoes

  • Dropbox

Instale o dropbox, baixe o arquivo dropbox.py de https://www.dropbox.com/install e inicie automaticamente

cd ~ && wget -O - "https://www.dropbox.com/download?plat=lnx.x86" | tar xzf -
cd .dropbox
wget https://www.dropbox.com/download?dl=packages/dropbox.py
chmod +x dropbox.py
./dropbox.py autostart y


cd ~ && wget -O - "https://www.dropbox.com/download?plat=lnx.x86_64" | tar xzf -
mv
    • Para iniciar automaticamente

to have it autostart, download the dropbox.py file per the link in the text. chmod +x it, then dropbox.py autostart y